Согласно отчету Счетной палаты РФ, Фонд кино столкнулся с критикой из-за недостаточной ясности и неэффективности в использовании средств для поддержки отечественного кино. В результате анализа за период 2017-2019 годов было выявлено, что решения принимались под влиянием заинтересованных сторон, а значительная часть средств, до 60%, направлялась на Кипр или фиктивные организации. Оказалось, что эксперты могли голосовать за свои собственные проекты, а неудачи в прокате не учитывались при распределении новых субсидий.
Поданным примером является случай с фильмом «Урфин Джюс и деревянные солдаты», который получил лишь часть своего бюджета назад, но на продолжение проекта выделены дополнительные средства. Всего за указанный период на киноиндустрию было выделено 22,8 млрд. рублей из российского бюджета, при этом значительная часть средств пошла на производство российских фильмов.
Согласно Счетной палате, процедура отбора проектов и распределения субсидий требует реформирования. В информации, представленной пресс-службой министерства культуры, сообщается о намерении установить новые правила отбора кинопроектов, которые будут рассматриваться для получения государственной финансовой поддержки в следующем году.